CRISPR-sgRNA设计

NCBI网站找到target gene 的CDS区域

• 第一步：打开菜单栏，下拉到Gene，在搜索框输入目标基因GSTP1，然后进行Search

  
  1.png

• 第二步：在Search后出现的页面里有很多种动物的基因，找到人的种属，单击进行查找

  
  2.png

• 第三步：新出现的页面是目标基因GSTP1的介绍，下滑到核苷酸序列，点击GenBank模式查找其基因序列

  
  3.png

• 第五步：最后保存我们查找到的序列，如图进行修改后，点击Create File Button就可以进行下一步分析了。

  
  4.png

网站设计sgRNA序列：

• 网站有很多，这里只介绍zhanglab的一个网站：

  
  点击：CRISPOR
  输入序列-选择物种和crispr种类

sgRNA设计对比（spcas9为例）

spcas9-sgRNA设计示意图1
spcas9-sgRNA设计示意图2

cas9原理介绍

• types of cas9

  
  image.png

• spcas9 示意图

  
  Wikipedia