【陪你学·生信】生信能帮我们做什么（1）

一、生信能帮我们做什么

生物信息学可以当作分子生物学的一个计算机分支。生物学中，在活体上的实验叫做in vivo；人工环境离体实验叫做in vitro；延伸一下，生信又可以视为in silico的生物学实验（经常在论文中看到这个描述）。

下面是生信研究的一些基础方向，可以对它有个大概的了解。

1. 分析蛋白质序列

现在我们都知道，蛋白质是由氨基酸组成的，第一次确定蛋白质的氨基酸序列是在1951年。

insulin=MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

现在分析蛋白质序列仍是生信的一个主要研究内容。包括从数据库中提取蛋白质序列；计算氨基酸组成，分子质量，等电点等其他参数；判断蛋白质是亲水性还是疏水性蛋白，预测抗原位点和跨膜片段位置；预测蛋白质二级结构单元和结构域；通过序列预测其3D结构并生成蛋白质3D结构可视化模型；寻找所有具有相似序列的蛋白质，进行多序列比对，对蛋白质进行归类并研究亲缘关系。

一些关于蛋白质序列的小知识

（1）蛋白质序列的顺序：由N到C

（2）蛋白质3D结构：第一个蛋白质的3D模型实在1958年确立的，后来人们建立了“相似氨基酸序列→相似结构→相似功能”的逻辑链，也是分子生物学和生信的理论基础。