转录激活验证实验方法
2018-08-06 本文已影响391人
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星空很美,美得不像话。在如此纬度的我们,貌似一辈子也无法亲眼看见。期待终有一天,自己可以记录如此绚烂的星空。
说实验,跑偏了。最近在做的实验,验证转录因子的转录激活能力,所以又有点想说的,就记录下来了。
1. 实验的材料
- AH109感受态细胞(你可以自己做酵母感受态,也可以买公司做好的,直接转化就可以),关于AH109菌株的介绍,可以看我之前写得简单文章。
- 培养基,就是用clontech公司的产品,酵母基本培养基及各种氨基酸缺陷的氨基酸,这家公司的说明书已经很详细,这里不再说明。
- Carrier DNA以及聚乙二醇/醋酸锂等试剂。
- X-α-gal和3-AT。
2. 转化步骤(直接省略,看说明书)
3. 挑单克隆鉴定转化是否成功
一般我还是会去做一下菌液PCR,来确定目的基因确实转化进去了。当然,这还是会有点浪费时间的,我在这里就直接将扩增好的单克隆菌液直接涂布在两者板上-TRP和-TRP/-HIS,直接进行筛选同时如果有全都生长的很好,且出现蓝色(含X-α-gal时),则能说明转化成功且有激活作用。(这里很关键的一点是,你必须要加3-AT,否则出现假阳性的结果可能性相当大,我在这次实验中就出现了假阳性,后面看图)
4. 涂缺陷板
- 配置4 mg/ml的X-α-gal和5 M的3-AT母液(X-α-gal是用来蓝白斑显示的,3-AT可以竞争性结合His,减少假阳性的出现)
- 两者可以都在配培养基的时候加入其中,我一般是将3-AT直接加入其中(100ml加入母液80ul),这里的浓度还是需要摸索的,可能不同的基因能力也不同,本次式样中,我的浓度4 mM就抑制了假阳性的菌株。而X-α-gal可以直接用4 mg/ml的浓度直接均匀涂抹在缺陷板上。
注意:这里的3-AT一定要添加,不然很可能出现假阳性,得出错误的实验结论。可以看到明显是抑制住了,第一排的菌。我发现,第一排的菌确是也长的慢,慢慢地后来也出现了蓝色,很明显差好多。这就是假阳性的预示。
没有添加3-AT
添加3-AT
5. 总结
很多时候,为什么说有些人一看就知道,你的实验结果不可靠,这不是没有道理的。自己做过实验,遇到过各种状况,所以一切显得很明了。别人的经验,还是能够帮助你少走很多弯路,但是有时候你可能不服,自己内心不是特别想听,也想知道不这样做行不行。当然,有时候可以没有问题,但是一旦问题出现的时候,你才会明白。
没有添加3-AT
添加3-AT