「Debug R」为什么你需要保持R包是最新的？

今天安装一个最新的R包的时候，提示要对一些依赖包进行更新，我没有管他。结果当我运行以前没有报错的代码时，却出现如下的报错，

报错如下

上面的报错出现在MacOS上，为了找到报错，我用Linux运行相同的代码并没有遇到报错。于是用sessioninfo()对R包版本进行比较。

通过不断的比较，最终将问题定位到XVector上，发现Linux的版本是最新的，而MacOS的版本是旧的。

MacOS Linux

进一步，我发现0.20.0版本是来自于Bioconductor 3. 7, 而最新的Bioconductor版本是3.8. 同时今天安装的包也来自于3.8的Bioconductor，因此出现了不兼容的情况，导致报错。

那么问题来了，XVector到底是什么？一直默默无闻的它到底有什么作用呢？我打开了他的帮助文档，仔细阅读了一下，结论如下:

XVector是R语言自带的Vector的强化，它允许"通过地址传值", 而不需要将在内存中新开辟区域将数据拷贝过去进行运算。 这样子的好处就是节约内存，不然你想获取一个非常大的一个向量中的第i到第j个元素，那你就得先开辟一个很大的一个内存空间，然后在进行取值，最后返回区间内的数值，时间花费非常的大。

读完这个函数之后，你会得出一个结论，XVector 是一个基础设施，提供一个XVector类，其他函数建立在它的基础上。应该还有一个更加底层的东西。

于是我又返回去看我加载包时的Warning信息，有一个concatenateObjectes引起了我的注意。

更底层的问题

我通过谷歌搜索，找到了最终的答案，原来是Bioconductor社区把一个底层函数改名了。所以建立在这个底层函数上摩天大厦就瞬间坍塌了。

3.7 3.8

开源软件的一大问题就在于此，新的工具为了不重复造轮子会依赖于已有成熟工具。已有的工具会不断的更新，如果突然有一天，作者把原有函数全改了，同时他居然还不提供的一个缓冲时间段，也就是让旧函数名和新函数名同时并存一段时间，结果你就傻眼了(放心，一个合格的程序员不会这样子瞎搞的)。

最后给两个建议：

• 请尽量保证你的R包最新
• 同时请用那些一直在维护的R包