Papers注意事项
刘小泽写于18.11.13
今天看了看期刊的一些注意事项，相信有很多小伙伴需要发文章吧，尽管每个期刊要求不同，但是大体了解下还是不错的😎这部分内容我肯定不专业，因为是第一篇自导自演的小文章，自己找课题、分析、写加修改、投稿，目前走了70%的流程。后来还需要修改被审稿人打回来的文章，大修+小修等等一系列的事情。虽然不专业，但是记录下来也是很有必要的
ETHICAL RESPONSIBILITIES
这是最重要的内容，虽然我们一般不会看什么安装说明之类的帮助文档，但是这个投稿守则需要认真对待。先给自己洗洗脑再说
根据Committee on Publication Ethics (COPE) 的要求，所有投稿必须遵守：
- 不能一稿多投，因此选择期刊很重要，否则你投出去，在没给意见之前，你是不能投另一个的，而这中间可能需要等至少一个月，甚至几个月的一审时间
- 一个单独的研究不能为了发多篇而拆分成几小块发给几家不同的出版社，或者几个小版块隔一段时间发给同一家出版社也不行
- 数据不能伪造以满足结果
- 逐字引用、总结别人经验都需要引用，对于一些有版权的数据还需要获得许可【一般重复率要低于30%，这30%中包括了引用部分。因为即使你引用了，检测软件还是会将他算作重复】
- 所有作者一致同意后才能发表；作者要检查所在单位、通讯作者、作者顺序无误后才能投，一旦文章被接受再修改作者顺序，那么会撤稿
- 修改阶段允许修改作者，但必须附带一封email说明情况，最好还有其他的证明资料，说明作者的贡献量
- 有时文章需要审查，作者需要准备原始数据、实验流程提供给审稿人，看能否得到一致的结论
TITLE PAGE
Title
包含作者名、简明扼要的标题、单位地址、电邮、16位ORCID（可选）
关于ORCID，能多写就多写，就相当于是自己学术的简历。经历不丰富的本科生、研究生，起码学校要写全
Abstract
150-250词，不能包含缩写和引用
Keywords
4-6词，为了作index快速找到这篇文章
TEXT
Text Formatting
- 正文用Times Roman 10号字体
- 斜体表示强调（比如一些基因、种名）
- 自动页面编号
- 不要用“域/Field”这个功能（比如自动导入的文献都属于域）
- 首行缩排用tab，不要用空格（可能word默认的tab是十几个空格，也就是2.27cm好像。要想设置成4-5个空格，先右键选择段落/paragraph=》然后左下角“Tabs”=〉设置“default stops” 为0.5cm左右即可）
- 文章中的表格用自带的table功能构建，不能从excel导入
- 插入公式推荐使用MathType，非常好用（一般下载完这个软件，就会在word中显示出MathType这个功能选项，然后选择“Inline”=》会打开Math软件=〉输入公式后“File=>Return to word”）
Headings
标题不超过三个级别
Abbrevations
各种名称的缩写应该先说明
Footnotes与Endnote
脚注（footnote）用来提供额外的信息，比如参考文献。脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释。
尾注（endnote）一般位于文档的末尾，列出引文的出处等
Acknowledgements
致谢人、基金（名称要写全）
TABLES
- 所有表格按阿拉伯数字编号
- 文中出现的表格都需要说明是哪一个，一般表示方法是（Table 1）
- 每个表格要有标题，解释其中包含的内容
- 如果表格出现了引用之前的研究结果，需要在标题结尾写明来源
ARTWORK AND ILLUSTRATIONS
Figure Lettering
- 为图片加文字，最好是Helvetica或Arial字体
- 字号一般是2-3mm（8-12 pt）
- 一张图中字号不一定要全部保持一致，比如坐标轴刻度和坐标轴标签可以有大小区别，但是差异大小要控制，像8号的刻度和20号的坐标轴标签就不可以
- 字不要加阴影、轮廓
- 图片中不需要加标题
Figure Numbering
- 所有图片用阿拉伯数字编号
- 讲到哪张图就引用哪张，注意顺序
- 图片中的小图可以用a，b，c这样的小写字母来表示
Figure Captions
- 每张图都要有简洁的标题，说明这图描述了什么；标题不要在图片中展示，要放到文稿中
- 图片以Fig.开头，然后加数字编号，也是粗体
- Fig.x后不能加标点，另外标题最后也不能加
- 检查标题中是否体现了全部的图片信息
- 如果引用的前人发表的图片，需要在标题后添加引用
Figure Placement and Size
- 理论上，图片应该和文本分开上传
- 图片的尺寸应该要和纸张宽度匹配
- 大部分杂志的图片宽度：39 mm, 84 mm, 129 mm, or 174 mm，不高于234mm
Accessibility
其实这个功能每一部手机中也内置了这个功能，比如熟悉的iPhone的小圆点。为了让所有人（包括残疾人）都能理解图片的内容，需要确保：
- 所有图片都有清晰描述的标题（为了盲人能听懂text-to-speech内容）
- 除了颜色区分还要有形状或者大小的区分（为了色盲患者）
- 所有图片的文字对比度至少要4.5:1
ELECTRONIC SUPPLEMENTARY MATERIAL
上传的附件应该包括：文章题目、刊物名称、作者姓名、单位和通讯作者电邮
包括的类型
- 视频：16:9或4:3，最大25G，通用格式均可
- 文本：pdf（doc与ppt格式可能由于未来版本的兼容问题而打不开）
- 表格：csv或xlsx
- 特殊格式：pdb（化学结构）、wrl（VEML）、nb（mathematica notebook）、tex
- 支持zip或gz压缩
文件命名与引用
- 将文件按次序命名，比如“ESM_3.mpg”, “ESM_4.pdf”
- 每个文件都应该有一个简要标题
- 引用时可以"... as shown in the animation (Online Resource 3)", “... additional data are given in Online Resource 4“
POTENTIAL CONFLICTS
利益冲突主要说明不同的作者在本研究中不同的利益角色，由通讯作者决定。比如主持某基金/主持某会议/身处多个单位等，虽然这也不叫冲突，但是需要把其中人物身份的关系展示一下
有利益冲突的，可以写
Funding: This study was funded by X (grant number X).
Conflict of Interest: Author A has received research grants from Company A. Author B has received a speaker honorarium from Company X and owns stock in Company Y. Author C is a member of committee Z.
没有利益冲突，一般就写
Conflict of Interest: The authors declare that they have no conflict of interest.
RESEARCH INVOLVING HUMAN PARTICIPANTS AND/OR ANIMALS
研究动物的，需要说明文章的伦理是否符合要求，比如
# 人类
Ethical approval: “All procedures performed in studies involving human participants were in accordance with the ethical standards of the institutional and/or national research committee and with the 1964 Helsinki declaration and its later amendments or comparable ethical standards.”
# 其他动物，如小白鼠
Ethical approval: “All applicable international, national, and/or institutional guidelines for the care and use of animals were followed.”
INFORMED CONSENT
一般这个内容需要得到相关人的许可
Informed consent: “Informed consent was obtained from all individual participants included in the study.”
RESEARCH DATA POLICY
杂志都希望作者将数据公开共享，公开的数据会做成DOI方便获取，如果需要引用别人的数据，那么需要使用这样的格式
DataCite: authors, title, publisher (repository name), identifier
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