分享一篇前辈的生信感悟

27岁这一年，我开始学生信
2017年，硕士入学，虽然当时月薪3000，我花了2000左右，在丁香园买了个科研课程中，虽然什么都没学会，但是邂逅了“生物信息学”和“R语言”这两个概念，就很值得。我当时就知道它们很重要，我一定要学会，可惜当时的我还没遇到生信技能树。当然，如果真遇到了，我可能也不会有现在这般的热情去学习它。所谓“知耻而后勇”，人只有受到足够大的刺激才能迸发出足够的激情。
虽然我不记仇，但是尴尬和难堪的记忆总是最深刻的，也是最能激励人奋进的。第一次去打听测序这件事，是因为研一时被硕士导师安排写PDX模型相关的综述，结果文章看多了，和PDX模型最相关的“肿瘤精准治疗”就吸引了我的注意力，从此，所有的科研想法就聚焦在这个理念上。于是经过校友介绍，认识了一些做测序的公司，一问价格，都是1例样本数万元起步，最后还来一句：“没钱做什么测序啊？”第一学期完成硕士课程后，就开始上临床干活，同时养细胞，只有偶尔失眠时爬起来打开RStudio，一知半解地完成一个列线图的教程，直到东方既白，右下角终于出了个很丑的图，把自己感动得热泪盈眶。等我需要开始做课题时，蹭着热点，做了MeRIP-seq和RNA-seq，等结果出来后，想画一张热图，有人说，“需要几千块一张”。有人说，“我们忙得要死，这么简单的图还是请客户自己画吧”。于是在我网上疯狂搜教程，用Excel画，用网页小工具等等，天天学，天天试，学得太专注，还毁掉我一段感情，结果却还是不理想。幸好这时遇到个靠谱的朋友，帮我完成了画图这项工作，才一起发表文章并考上博士，是幸运协助导师中了个面上项目，硕士圆满毕业。
2020年，博士入学的前一天，我给自己列了许多任务，第一项就是学会R语言和生信分析。可是，自学实在太不容易，一看书就困，漫无目的地做练习题就觉得浪费了我看文献的时间，思绪来回拉扯，无比纠结。某一天，不知在哪里收到一条讯息：“Hitplot”在线数据分析平台要开发布会。我迫不及待去听了，发现这些工具的开发者居然都是全国各大医院的医学生。在感受到巨大差距后，我很失落，同时也很振奋。我当时产生一个想法，“未来医学科研工作者会分为两类，老一辈的凭借深厚的知识底蕴，知道该做什么样的研究，年轻一辈通过大数据分析，机器学习等方法，才能知道做什么方向更好。”于是，借着免修英语的空挡，我去蹭了给硕士开的生物信息学课程。虽然能学到不少基础知识，但是仍然缺乏R语言实操。
转折点出在偶然间和室友聊起生信分析，他说这个不难，B站上有很多教程。于是，我第一次上了B站，第一次看到了生信技能树的免费视频。但也只是看了一点点，因为我总觉得免费的东西估计作用不大。幸运的是，我关注了这个公众号。之后就是按部就班地上完博士课程，看文献，想把硕士期间发现的东西延续着做一做，偶尔艰难地推进R语言的学习。直到完成期末考后的某一天，我在生信技能树上看到一条“数据挖掘培训”的推送，就像遇到了命中注定的那个人一样，仅仅只看完标题，我就马上给博士导师发消息，请求暂时不要拉我回临床，给我2个月时间，让我把这个课程学完。导师让我再好好考虑一下，这个课程是否真的值得学习。我回答说：“不用再考虑了，我等这样的课程已经等3年了。”
实在感谢导师的信任，不仅给我时间，还报销了课程报名费。于是，我从2021年1月份开始听课，终于如愿以偿，下载到了我想研究的数据集。之后，我给自己配了台式机，除非吃饭或者偶尔的临床任务，其余所有时间，我都是坐着或者站着电脑前看教程，改代码，再看教程。直到2021年12月份，我已经完成2篇文章的分析，目前等待着验证结果，也借此完成了博士开题。目前，我认为转录组水平的分析，只要是R语言能完成的，通过各种教程的学习，都能实现，只是所需的时间长短不一而已。另外，我也不会满足于此。我还在进一步学习RNA-seq上游分析以及DNA层面的大数据分析，希望同时学好Lunix和Python，以进行更大规模和更高级的数据挖掘。
结合自己前期的科研经历，我希望在未来能以大数据分析为基础，结合分子生物学技术、计算机辅助药物以及复合生物材料，建立一个完整的研究体系，从临床问题出发，逐步探究恶性肿瘤这一世纪难题。虽然现在还没有太多经费，但是感觉自己有方向，不迷茫，每天叫自己起床的都是“希望”。再次感谢导师，感谢健明老师、小洁老师以及生信技能树全体成员。
2021年12月23日星期四
写于27岁生日前一天