如何使用peakview软件查看AB SCIEX 质谱下机数据

原创 如期生物

一、软件安装

1、解压软件安装包，打开Launch程序（以管理员模式安装，安装前请退出杀毒软件）

2、打开安装程序，找到InstallAnalyst TF 1.6 Software，单击打开进行安装

3 、按默认安装程序完成软件安装，安装完成后桌面出现 Analyst TF 1.6 Software 快捷方式

4、接下来，重新打开步骤1中的 Launch 安装程序，点击 Install Companion Software →PeakView 1.2

5 、同样按照默认程序， 点击下一步完成安装，软件安装完成后打开 Analyst  TF  1.6  ，可以找到安装好的 PeakView 软件， 双击打开

或者找到桌面快捷方式直接打开（下图）

6、打开后，界面如下：

7、单击 Help→Utilities →XIC Manager Installer.msi，双击 XIC Manager Installer.msi，按默 认进行安装，安装完成后重启软件， 发现菜单栏中已经出现 XIC Manager 选项，说明软件安 装完成。

小结：软件没有时间使用限制，需要安装包的可以关注一下公众号并私信一下小编获取，谢谢。软件仅限于科研查看原始数据使用。

二、软件使用

1、导出TIC总离子流图

1.1(File-open wiff Sample-打开数据路径-选择要打开的原始数据-OK)

1.2(Show-Total Ion Chromatogram(TIC))

1.3(选择MS1-OK)

1.4 放大目标图片

1.5打印成PDF（File-Print-Print Pane)

2、根据特定质荷比导出EIC图

2.1打开原始数据（方法同1.1）

2.2.(Show-Extract Ion Using Dialog(XIC))

2.3(选择MS1-OK)基于1级进行抽提

2.4 在Center中输入质荷比，在Width中输入绝对质量误差0.05(Da),有名字的可在Compound中输入名字或者ID号代替。点击OK.

如果是我司做的质谱检测，质荷比可以直接从质谱鉴定EXCEL表中选择输入，Precursor m/z为目标离子质荷比、RT (min)为该离子出峰的保留时间。

也可以通过分子式计算，理论质荷比，进行抽提。peak view也提供理论质荷比。方法如下：

A:Show-Mass Calculators

B:Isotopic Distribution-输入目标分子式-输入电荷，小分子一般为1或者-1，再选择加合离子H-点Calculate，得到理论质荷比。

2.4 得到EIC谱图，可打印成PDF（File-Print-Print Pane)

3、查看目标峰二级谱图

3.1打开原始数据（方法同1.1）

3.2提取目标一级EIC图，以确定保留时间（方法参考2、根据特定质荷比导出EIC图）

3.3根据目标峰的保留时间，点击IDA模式质谱图（含2级谱图），点显示谱图信息

3.4选择1级、2级谱图分开显示模式，如下图

3.5通过键盘中“←”“→”左右箭头键盘，找到目标离子，二级谱图。