办公神器生信星球培训第九十七期

系统学生信D1-

2021-01-23  本文已影响0人  五官端正123

写在开头

终于开始系统的学习生信了,在今天之前的接近1个月的时间里,几乎每天熬夜学习数据挖掘,但是仅仅停留在表面,目的很简单,就想学会套路,写文章,想必很多小伙伴都是跟我一样的想法。
在查找资料的时候发现了生信星球,继而发现了豆花组合,很羡慕他们,也祝福他们。
希望我们97期培训班的小伙伴都能学到自己想要的东西。

第一天的学习笔记

通用搜索引擎:
我们的教程中提到的软件、网页等等,全部可以搜到。学会搜索是学习任何新知识的第一步,包括以后要下载软件、解决报错、某个不够详细的点想要展开自学等,都需要搜索,这是必须的。
首选-谷歌,其次-必应,另外推荐一个大神级的搜索引擎:虫部落快搜。里面几乎集成了所有的搜索引擎啦!
专业教程,推荐使用:
搜狗微信、搜狗知乎、简书、github
你并不需要链接!!因为直接去搜网站名字,就能搜到,大多数的人会想不到可以搜索,学生信,或者说学编程语言,必须有搜索的思维和意识哦。

哈哈,很无耻的把内容都复制过来了,因为这也是之前我在学习新东西的感悟,一定要学会应用各种搜索引擎,文章里推荐了搜狗、微信、知乎、简书、github,其实还有一些别的,比如CSDN360doc个人图书馆生信菜鸟团等网站,都会有很好的知识分享,当然在搜索的过程中,也会发现一些大牛自己建立的个人博客。

  1. 一定要带上下文和截图
  2. 学会利用微信群,不止我们这一期的培训班的群,在一些网站上看到的关于技术有关的群都可以申请加入。
  3. 论坛——是我想增加的一点,在我前期的学习过程中,给大家推荐一些论坛,比如丁香园经管之家生信技能树小木虫知乎等。这些地方也是我们为解决各种疑难杂症去求医问药的宝地。
  1. chrome
    自己以前一直在使用360激情浏览器,因为感觉它很激情,哈哈哈哈,主要是从上大学一直在用,使用顺手了,并且一些很有用的收藏都在上面,其实内核都是chrome,此类的浏览器还有火狐浏览器,不知道大家发现没,这个火狐浏览器似乎是很多考试报名钦点的浏览器。
  2. everything
    连接一下下载地址
    同样推荐,比较好用。
  3. 截图工具
    个人喜欢用微信的截图,萝卜青菜各有所爱~
  4. 幕布和Xmind
    自己用的是幕布,是从Jimmy大神的视频教程里看到了这个软件,看他做的思维导图很好看,就下载了一个,基本功能是免费的,不过也足够使用了,没有用过Xmind这个软件,不做评论,不过此类软件都是大同小异,网上还有很多类似的软件,以及一些在线网站也有同样的功能,比如百度脑图,我也没有用过,但是听说过,哈哈。
  5. 笔记软件

最后再聊聊Markdown,写这篇文章的时候是根据教程1教程2以及写作界面里面的Markdown语法参考完成的。

image.png
整篇写下来还算比较顺手,哈哈。
用熟练了应该会更舒服一些,现在很多网站和App都开启了Markdown支持,方便发文,R语言中也有Markdown,不是很熟悉,不知道是不是一样的功能,还有待进一步开发。
#把pdata临床信息中的 title列按照_分割
#[,2:3]取title列中第2-3列
group_list=str_split(pd$title,'_',simplify = T)[,2:3]

#class(group_list)
x=group_list[1,]#把group_list第一行数值赋值为x,
#《R语言实战》P95,apply函数用法
group_list=apply(group_list,1,function(x) paste(x,collapse='_'))#对每一行进行操作
#函数apply用法:apply(X, MARGIN, FUN, ...)
#X: an array, including a matrix.
#MARGIN: 1:行操作; 2:列操作
#FUN:函数名

#得到下面结果
#[1] "at 3h after trauma_rep1"  "at 3h after trauma_rep2" 
#[3] "at 3h after trauma_rep3"  "at 6h after trauma_rep1" 
#[5] "at 6h after trauma_rep2"  "at 6h aftert rauma_rep3" 
#[7] "at 12h after trauma_rep1" "at 12h after trauma_rep2"
#[9] "at 12h after trauma_rep3" "at 48h after trauma_rep1"
#[11] "at 48h after trauma_rep2" "at 48h after trauma_rep3"
#[13] "sham_3h"                  "sham_6h"                 
#[15] "sham_12h"                 "sham_48h"     
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