基因FOCUS

一．产品背景                                                                                                             

1.在人类基因中大约有180,000外显子，占人类全基因组的1%，约30MB。

2.人类全基因组的蛋白编码区域（外显子）大约包含85%的致病突变。

3.全外显子，称为“外显子组”（Exome）。全外显子测序，即外显子组测序（Exome sequencing），是利用高通量测序（二代测序）的基因组分析方法。 外显子测序相对于基因组测序成本较低，是一种选择基因组的编码序列的高效策略，对研究已知基因的SNP、Indel等具有较大的优势。

4.亚全外显子测序，又称临床外显子测序，是在全外显子基础上，筛选当前OMIM收录相对明确的可解读的致病基因。进一步降低费用成本，提高送检率和诊断率。

5.基因FOCUS测序，又称mini亚全外，是在当前OMIM收录相对明确的可解读的致病基因基础上，筛选相对高发和（或）可干预的疾病，更大程度的降低费用成本，并能相对大概率的发现遗传性疾病。

参考文献：1.Ng S B, Turner E H, Robertson P D, et al. Targeted capture and massively parallel

sequencing of 12 human exomes[J].Nature, 2009, 461(7261):272-276.

2. Choi M, Scholl U I, Ji W, et al. Geneticdiagnosis by whole exome capture and massively parallel DNA sequencing[J].Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009, 106(45): 19096-19101.

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二．产品特性和参数：

1.基因和疾病数：480个基因，550种遗传病。

2.性价比高：与其他小panel比较，优惠更大（阳性样本父母免费做一代验证）。

3.检测分析方法：

①二代测序（安捷伦捕获试剂盒，Illumina测序平台等）。

②业内专业的产品设计，有效检测基因外显子区和明确致病的内含子区、启动子区突变。

③平均测序深度达200X，20X覆盖度达99%以上，可有效检测点突变和计算拷贝数变异。

④针对特殊基因、特殊突变设计单独算法，最大程度保证特殊的热点突变不会漏检。

4.检查周期：35天

5.适用科室：儿科，新生儿科，内分泌科，神经内科，消化内科，康复科等。

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三、产品设计思路和目的

1.对于疑难杂症，表型多样的可疑遗传病患者，虽然亚全外显子提供相对全面的检查，但是也经常有因为价格过高，使得部分患者或家属拖延或放弃检测的，基因FOCUS方案从价格上相对优惠，并能大概率的发现遗传代谢性疾病，提高早期诊断的机会。

2.临床上高度怀疑某疾病，但并没有针对该病的一代测序或简单试剂盒，必须使用二代测序检查时，若该疾病存在于基因FOCUS检测项目中，则可以仅使用该方案检查来节约成本。如糖原累积症，甲基丙二酸血症，胆汁酸合成缺陷等。

3.对于疾病表型多样，治疗效果不佳，反复发作，发病年龄相对过早，致病原因多样的患者，可以选择该方案，以低成本并大概率的快速基因检测排查遗传病因。

4.该方案设计了可干预的遗传病的致病基因，协助临床早检测早诊断早治疗。

5.基因设计来源

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四.基因FOCUS的适应范围

1.适用于怀疑遗传性疾病，尤其高度怀疑遗传代谢性疾病，低成本的相对大概率的快速基因筛查。

2.对于表型多样、症状反复、治疗效果不佳的新生儿患者，做为广谱筛查尤为适用。

3.针对某种疾病，无单基因或单种疾病测序试剂盒，当该方案中覆盖此疾病时，可以节约成本查找致病基因。

妇儿遗传项目组宣

2017年4月