单细胞转录组简介

探序基因肿瘤研究院

实验大致操作步骤：

对组织进行细胞解离，看细胞解离后是否完整；细胞合格后进行上平台，行成单个细胞的油包水等操作，构建测序文库；上机测序，数据量大概是100G；生物信息分析

知名平台：10x genomics

使用10x genomics测序，一个标本大概1.6万到2万多，具体根据所选择试剂盒和是否包含TCR BCR，CITESEQ等来决定

细胞解离步骤比较关键，有些样本好处理，有些不好处理。对于不同类型标本，要不断摸索细胞解离程序，以提高成功率。像肿瘤穿刺标本，不太好处理，最终很多会因细胞质量不好，或细胞数量不足，导致无法上机。比如胰腺癌穿刺标本，很容易失败。