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PPRD,45000个植物公共RNA-seq文库

2022-04-14  本文已影响0人  花生学生信

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Plant Public RNA-seq database, Zhailab@SUSTech

网站概述

● PPRD由玉米(19,664),水稻(11,726)和大豆(4,085),小麦(5,816)和棉花(3,483)的RNA-seq库组成。

● PPRD使用标准化渠道来计算每个文库中每个基因的表达水平。

● PPRD可以搜索输入基因ID和文库ID,并返回基本描述和表达水平。

● PPRD支持下载和共享搜索结果。

● PPRD还具有内置的IGV-Web界面。

● PPRD还支持方便地访问其在其他物种中的同源物以查看其表达。

实验设计类型及编号 搜索、可视化、浏览和下载基因 FPKM 数据 可以查找一个库或者多个库 基因的表达量 查询多个基因信息

参考链接:

实用!45000个植物公共RNA-seq文库的在线搜索平台公布 (qq.com)

Plant Public RNA-Seq Database(PPRD), Zhailab@SUSTech, Jixian Zhai, Zhai Jixian

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