提升IGV打开文件速度
2020-03-04 本文已影响0人
hygine
在使用IGV展示测序深度时,可以用igvtools先计算出tdf文件再导入IGV中,这样比直接导入bam文件快很多。在tdf文件中,其测序深度和bedtools软件的计算结果是一致的,也是只统计了read数目,没有做过滤。
在使用IGV展示测序深度时,可以用igvtools先计算出tdf文件再导入IGV中,这样比直接导入bam文件快很多。在tdf文件中,其测序深度和bedtools软件的计算结果是一致的,也是只统计了read数目,没有做过滤。