R IN ACTION SELF-TUTORIAL-70 Com

• devtools 安装报错，所以用以下方法进行安装：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
        install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("ComplexHeatmap")

# 应用
library(grid)#是以来这个包
library(ComplexHeatmap)

CmplxHtmp<-heatmap(log(transferred_peakdt),)
CmplxHtmp

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• 导入ggplot一直报错，里面的函数也报错，卸载重装又报错，最终根据提示解决了以下两个问题，再导入，就没问题了！

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• 问题1： 载入了名字空间‘ellipsis’ 0.3.1，但需要的是＞= 0.3.2

package or namespace load failed for ‘ggplot2’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
载入了名字空间‘ellipsis’ 0.3.1，但需要的是>= 0.3.2
粗暴的解决方法

找到报错的包的名字，如我的例子中是ellipsis, 直接到Rstudio 右下角的框的Package栏，右边 x图标 remove它，再在console 控制台install.packages(“ellipsis”), 解决。

图片.png

• 代码如下：

install.packages("ellipsis")

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• 问题2：library(ggplot2)

错误: package or namespace load failed for ‘ggplot2’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
载入了名字空间‘vctrs’ 0.3.6，但需要的是>= 0.3.8
此外: Warning message:
程辑包‘ggplot2’是用R版本4.0.5 来建造的

remove.packages("vctrs")
install.packages("vctrs")