各种常用数据库合集
KEGG and GO
蛋白网站
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UniProt （强大的蛋白结构和功能注释网站）
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HPA（可查看蛋白表达以及亚细胞定位）
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String （PPI）
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BioGRID(相互作用蛋白的PPI网络图)
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TCPA与TCGA相对应，用于访问可视化肿瘤蛋白组学网站
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PDB蛋白结构数据库
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SWISSMODEL蛋白3D结构预测
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Pfam蛋白结构及功能预测
基因及蛋白分析网站
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GEPIA可进行基因表达、共表达、预后等分析
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TIMER可进行基因表达、共表达、预后、免疫等分析
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Cbioportal数据库之神可进行突变、突变结构、共表达富集等分析 网站使用说明
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Linkedomics可分析基因在不同肿瘤的表达以及相关基因的表达
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BioGRID可以查询基因、蛋白、药物、PPI、关联基因、GO等可以关联到好多其他网站，功能强大！
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UALCAN相关基因以及预后
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Depmap肿瘤细胞系、基因、药物
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TISIDB查询基因、基因富集（GO KEGG）、免疫等信息
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TCPA与TCGA相对应，用于访问可视化肿瘤蛋白组学网站,关联基因，生存分析
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CTD药物基因疾病相互作用分析
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chilibot可绘制基因表型互作图
查询基因信息
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genecards查询基因详细信息 - 非常强大，会直接连接到HGNC/HUGO,NCBI,ensembl,OMIM,UniProt 网站
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Genome Browser Gateway还可查询基因启动子序列
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DISEASE查询基因与疾病
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BioGPS查询基因详细信息以及基因在细胞和组织中的表达量
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EMBL-EBI可查询基因蛋白化合物信息
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ensembl基因浏览器+gene ID转换
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TISIDB查询基因、基因富集（GO KEGG）、免疫等信息
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HGNC/HUGO可查询基因信息
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COSMIC可查询基因突变信息
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OMIM包括文本信息和相关参考信息、序列纪录、图谱和相关其他数据库。
细胞系信息网站
分析关联基因：
生存分析
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PrognoScan 可分析特殊GEO数据集预后
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TCPA与TCGA相对应，用于访问可视化肿瘤蛋白组学网站,关联基因，生存分析
药物分析
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GDSC药物细胞系敏感性分析网站
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Depmap肿瘤细胞系、基因、药物
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BioGRID可以查询基因、蛋白、药物、PPI、关联基因、GO等可以关联到好多其他网站，功能强大！
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CTD药物基因疾病相互作用分析
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Drugbank药物查询网站
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EMBL-EBI可查询基因蛋白化合物信息
免疫分析
特殊数据库
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eFORGE 表观遗传数据库
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CellMarker 细胞标志物数据库,可用于单细胞测序
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COSMIC癌症体细胞突变数据库
通路可视化数据库
Selleckchem : https://www.selleck.cn/ 抑制剂
CRISPRlnc : http://www.crisprlnc.org/ crispr/lncRNA
MRPrimerW2 : http://mrprimerw2.com/ qPCR引物
ChIPprimersDB : https://www.chipprimers.com ChIP-PCR引物
PrimerBank：https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/ qPCR引物
Addgene：http://www.addgene.org/ 载体信息共享网站
2.实验protocol数据库 Jove : https://www.jove.com 视频/权限
bio-protocol : https://bio-protocol.org/cn/default.aspx protocol
Current Protocols : https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/ protocol
Nature protocol : https://www.nature.com/nprot/ protocol
Springer Protocols : https://experiments.springernature.com/springer-protocols-closure protocol
Cold Spring Harbor Protocols : http://cshprotocols.cshlp.org/ protocol
