fslview display specific white m

2019-08-22 本文已影响1人 Galory

在对JHU的WMlable模板使用fslview图形界面点击时显示的总是双侧，但是对于其他的模板则没有此问题，经查询，这是fslview的一个bug，替代的方法是使用fslmaths命令来借助于代码制作mask。
方法如下：

Step 1：打开fslview，然后打开一个模板作为背景（比如MNI＿１５２模板），再打开一个想要选择的atlas，保存为模板，然后使用下边的命令把感兴趣的区域设置一下，

fslmaths JuelichAtlas.nii.gz -thr 3 -uthr 5 CC.nii.gz

This zeroes out any number below 3 or above 5.

紧接着，如果只是为了呈现，就不需要二值化；如果想要制作ｍａｓｋ，再使用下面的命令二值化，

Lastly, we need to binarize the image, again using fslmaths:

fslmaths CC.nii.gz -bin CC_bin.nii.gz

20190822

image.png