Nature Medicine五大佬撰文：新冠病毒非人工合成
原创 montreal 生信人 3月19日
3月17日，Nature杂志子刊Nature Medicine以Correspondence形式刊登了来自五位业内大佬的文章，文章表示新冠病毒（SARS-CoV-2）应该非人造产物。这几位大佬包括（下图左起）：美国斯普利普斯研究所（The Scripps Research Institute）的免疫生物信息学家Kristian Andersen、英国爱丁堡大学分子进化学家Andrew Rambaut，美国哥伦比亚大学免疫学家Ian Lipkin、澳洲悉尼大学的病毒进化学家Edward C. Holmes、美国杜兰大学（Tulane University）免疫学家Robert Garry。其中通讯作者为Andersen。
本文首先进行了基因组学、结构生物信息学及免疫学等方面的数据分析，基于以下两点原因，大佬们认为新冠病毒绝非人造。
一， 如果该病毒为人造，则更应该基于已知病毒的骨架（backbone）。然而，该病毒同一般的冠状病毒序列差异较大，反而同穿山甲和蝙蝠身上所发现的冠状病毒序列相似度相对较高。
二， 该病毒刺突蛋白（spike）与人受体的结合能力非常高，这是由于其受体结合结构域receptor-binding domain（RBD）进化的结果。不过，生物信息学预测似乎并不支持该序列与受体的结合的高效性【1】，computational analyses predict that the interaction is not ideal7 and that the RBD sequence is different from those shown in SARS-CoV to be optimal for receptor binding。也就是说，作者们认为，假使真的有人想制造类似的高效结合能力的冠状病毒，应不会做出如此的设计，据此推断新冠病毒的RBD序列应该是自然选择（natural selection）的结果。
此外，作者们还对新冠病毒的可能起源提出了两个猜测（小编认为这其实也是很明显的）。一个可能性是，该病毒在动物中已经进化成这种超强的致病状态，然后通过偶然事件感染人类。这一可能性较符合以往经验，比如SARS是从果子狸到人后立即引爆03年的非典疫情。而第二种情况，病毒最初由动物转移到人类后经过一段时间才进化出目前的致病性。显然，第一种可能性无疑更为恐怖，因为确保未来不会有类似事件——已具备致病性的新冠病毒的“亲戚”由动物转移到人——是要花一定力气的。
要注意，作者们在原文里表示：新冠病毒非实验室出品，而并不是说未发现证据表明新冠病毒是人工合成。换言之，作者们认为他们发现了evidence of absence，而不仅是absence of evidence，用斩钉截铁形容其语气毫不为过。原文的话：Our analyses clearly show that SARS-CoV-2 is not a laboratory construct or a purposefully manipulated virus。
如若真如作者们所言，所谓病毒来自中国或美国研究所的阴谋论可以偃旗息鼓了。不过，也有网友有其它看法。比如来自哥伦比亚哈维里亚那天主教大学（Pontificia Universidad Javeriana）的生物信息学家Diego F. Pereira就不买账：
下面这位印度网友对为何RBD的强结合力可以作为“病毒非人造”的证据：
还有网友对文章是否经过同行评议有疑问。对此，小编猜测一下该位网友的逻辑：该文未提供投稿时间，我们姑且根据发表时间和文章第一段提到的截至3月11日的全球病情数据认为从投稿到在线发表最多有六天时间，如此短的时间暗示不一定经过审稿过程。
逐条逐条看上去，这些质疑似乎基本都来自圈外，大多数甚至从事和生物学毫不相关的职业，大概对于相信阴谋论的人，无论怎样的科学解释都没有用，尽管从另一个角度讲，学术圈象牙塔里的学者们恐怕也不敢在公开场合表达类似的看法吧。
引文
1. Wan, Y., Shang, J., Graham, R., Baric, R. S. & Li, F. J. Virol. https://doi.org/10.1128/JVI.00127-20 (2020).
2. 中国生物技术网 2020 美英澳科学家《自然医学》再添力证：新冠病毒乃自然进化产物
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作者原创，原载于生信人公众号
