[R]R包ChAMP学习资源整合
2018-11-09 本文已影响17人
郑宝童
今天，一个小师妹问我用过ChAMP这个包没？本着不重复早轮子的原则，我又不要脸的开启了一波ChAMP学习资源的整理。
我们先把ChAMP安上，嘿嘿，其他一切都好说
# R>3.50安装ChAMP bioconductor近来启用新的R包安装方式，替代以往source("...") bicLite("...")
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("ChAMP", version = "3.8")
# R<3.50安装ChAMP
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("ChAMP")
详细的帮助文档可以通过以下命令行查看
browseVignettes("ChAMP")
帮助文档的简单译文如下：
[R]ChAMP帮助文档译[上]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline)
[R]ChAMP帮助文档译[下]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline)
万能的网络啥都有，来来来，来一波ChAMP学习资源的目录：
