质控Trimming和比对的一些参数

trim主要用于：截去测序数据的测序接头和低质量片段

Clean_ratio：Clean_bases的数目占Raw_bases数目的百分比

Q30：Phred数值大于30的碱基占总体碱基的百分比

（表示一个碱基的质量值，也表示该碱基错误率百分比。Q30指碱基质量值为30，错误率为0.1%，正确率为99.99%。同理Q40表示错误率为0.01%，正确率为99.999%。）

Phred：每个碱基测序错误率是通过测序碱基质量值（Phred score，Qphred）通过公式转化得到

MAPQ (Mapping Quality，比对质量值)：reads比对到参考序列上某个位置的可靠程度

用错误比对到该位置的概率来表示： MAPQ = -10log10(P)，P是错误比对的概率。

当MAPQ为13时，相应的P是0.05，（reads的比对错误的概率是0.05。）

当MAPQ为20时，相应的P是0.01，（reads的比对错误的概率是0.01。）