安利我的毕业论文-关于生物信息学分析、多组学分析、机器学习的应用

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附录A 本研究纳入研究的数据下载与整理

• 基因芯片数据下载 、整理
• TCGA 数据的下载 、整理
• GTEx 数据下载、整理
• ICGC 数据下载、整理
• CCLE 数据下载、整理
• GTF 注释文件下载、整理
• 批次效应矫正
• PCA
• 基因注释
• Venn Diagram

附录B 加权基因共表达网络分析（WGCNA）

附录C 差异表达分析

• 基因芯片的差异表达分析
• 转录组测序（RNA-Seq）数据的差异表达分析：DESeq2、edgeR、limma

附录D 多组学分析

• 基因突变分析
• DNA甲基化分析
• 免疫浸润分析

附录E 机器学习构建模型

• 预测模型构建：支持向量机、随机森林、神经网络........
• 预测模型验证