NAR2019数据库总结——mCSM-PPI2 突变对蛋白相互作

mCSM-PPI2是一个可以用来预测突变对于蛋白亲和力的影响。进而评估突变对于蛋白之间相互作用的影响的数据库。

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这个网站提供了两种功能：

• 预测：预测一个突变或者一系列突变对于蛋白亲和力和相互作用的影响
• 连接点分析：分析一个蛋白或者多个蛋白的哪些突变可以影响其相互作用。

预测

输入

预测功能的输入就是输入蛋白突变的位置。如果是一个，那就在Single Mutaion里面选择。如果是多个则在Mutation List当中选择即可。

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输出

如果是Single Mutation则会直接显示突变改变后影响的信息。如果是Mutation List则会变成先出一个列表总结。然后同样可以看单个突变的信息

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我们点击Details可以查看详细信息。详细结果分为三个部分

1. 我们可以看到突变对于蛋白亲和力影响的具体值和具体总结

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2. 通过一个3D结构来展示突变的对于蛋白的影响

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3. 分析野生型和突变型残基之间的相互作用。

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连接点分析

输入：

输入部分主要输入蛋白的ID号即可。主要的功能分为两个部分：丙氨酸扫描:寻找和丙氨酸有关的所有突变；饱和诱变:19种氨基酸所有相关的突变

输出

结果当中包括了

• 每个突变的基本信息

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• 突变效能影响的柱状图

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• 所有图标的位置的3D可视化

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• 以及相关的热图

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下载

同时数据库也提供了所有原始数据的下载的

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