dotPlotly
2022-04-14 本文已影响0人
ayunga
1.目的
使用 dotPlotly 可视化 minimap2 或者 mummer 得到的序列比对结果。
2.安装
dotPlotly 其实就是个R程序，运行依赖3个R包。这里就直接搞了个conda环境，把对应的R包装上而已。
dotPlotly 程序从github下就好。
conda create -n dotPlotly r-base
conda activate dotPlotly
conda install r-optparse
conda install r-ggplot2
conda install r-plotly
git clone https://github.com/piyixing/dotPlotly.git
3.使用
conda activate dotPlotly
mummerCoordsDotPlotly.R -h
