两个

生信分析 年度十大热点特征基因

2020-12-29  本文已影响0人  概普生信

2020在疫情似乎要反扑的苗头中接近尾声了,在这坎坷的2020里因为疫情我们错过了很多相聚,错过了一些爱情,也许更多的是错过了好多科研好idea😂。同样,这一年里生信人也经历了诸多坎坷,生信人始终相信坚持初心才会越走得更远,非常感谢大家的不离不弃。今天生信人给大家盘点下生信人分享过的最简单基因集 signature发文,以及分享生信人2020年最后一个基因集预后新思路。

以下图片均来自生信人小程序:科图show(拆图(弹)专家)ktshow.gaptools.cn/

1、免疫基因集(热度一直不减,各种变形一直在发文)

题目A novel immune-related genes prognosis biomarker for melanoma: associated with tumor microenvironment

杂志:发表于19年4月 aging-us | IF:4.831

内容:WGCNA+免疫预后signature

2、m6A基因集(热度一直不减,各种变形一直在发文)

题目:RNAMethyPro: a biologically conserved signature of N6-methyladenosine regulators for predicting survival at pancancer level

杂志:发表于19年5月 NPJ Precis Oncol.  | IF:7.717

内容:m6A预后signature

3、自噬基因集

题目:Identification and validation of an individualized autophagy-clinical prognostic index in bladder cancer patients

杂志:发表于19年5月 OncoTargets and Therapy | IF:3.337

内容:自噬预后signature

4、假基因集

题目:Identifification of a Five-Pseudogene Signature for Predicting Survival and Its ceRNA Network in Glioma

杂志:发表于19年10月 Frontiers in Oncology | IF:4.848

内容:预后signature+ceRNA网络构建

5、EMT基因集

题目:Genomics and Prognosis Analysis ofEpithelial-Mesenchymal Transition inGlioma

杂志:发表于20年2月 Frontiers in Oncology | IF:4.848

内容:聚类+EMT预后signature

6、转录因子基因集

题目:PLXNC1 Enhances Carcinogenesis Through Transcriptional Activation of IL6ST in Gastric Cancer

杂志:发表于20年2月 Frontiers in Oncology | IF:4.848

内容:IF预后signature

7、缺氧基因集

题目:Characterization of Hypoxia Signature to Evaluate the TumorImmune Microenvironment andPredict Prognosis in Glioma Groups

杂志:发表于20年5月 Frontiers in Oncology | IF:4.848(还是这个杂志😆)

内容:Hypoxia预后signature

8、代谢基因集

题目:Combined analysis of RNA-sequence and microarray data reveals effective metabolism-based prognostic signature for neuroblastoma

杂志:发表于20年6月J Cell Mol Med.| IF:4.486

内容:代谢双预后signature

9、缺氧+免疫 基因集(double 内容更丰富)

题目:Identifification and validation of a combined hypoxia andimmune index for triple-negative breast cancer

杂志:发表于20年7月  Mol Oncol. | IF:6.574

内容:缺氧+免疫 预后signature

10、铁死亡基因集(目前炙手可热)

题目:A Novel Ferroptosis-related Gene Signature for Overall Survival Prediction in Patients with Hepatocellular Carcinoma

杂志:发表于20年7月 Int J Biol Sci. | IF:4.858

内容:铁死亡 预后signature

11、血管生成因子

注:这就是我们今天要分享的基因集新思路了哦,详细信息见次条

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