群体研究之遗传图谱构建及QTL定位
2018-08-06 本文已影响209人
Thinkando
本文是迈百客群体遗传学线上培训笔记
1. 基础知识
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质量性状，是指同一种性状的不同表现型之间不存在连续性的数量变化，而呈现质的
中断性变化的那些性状（花的颜色等）
- 特点：个体间差异是不连续的，不容易受环境影响，受一对或少数几对主效基因控制
- 数量性状， 是指在一个群体内的各个体间表现为连续变异的性状（动植物的高度或长度）
- 特点：个体差异是连续的，容易受环境影响，难以在个体间明确分组，受多个基因调控
- QTL(quantitative trait locus)，即数量性状座位或者数量性状基因座， 指的是控制数量性状的一个染色体片段。
- QTL 定位确定数量性状基因在染色体上的位置的一种方法。
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遗传图谱(genetic map)又称遗传连锁图谱，是指依据基因(或DNA标 记)在染色体上的重组值(或交换值)，将染色体上的各个基因/标记之间 的距离和顺序标志出来，绘制而成的图谱。
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- 图谱构建的理论基础
- 基因重组和连锁理论发生时期为减数分裂生成配子时期
- 连锁图谱构建的理论基础是染色体的交换与重组。
- 基因的重组是通过一对同源染色体的两个非姐妹染色单体之间的交换来实现的。
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- 重组率
- 重组型配子占总配子的比例称为重组率，用r表示
- 重组型配子出现的最大可能比例是50%;
- r的变化范围一般在0~0.5之间，0表示完全连锁，0.5表示不连锁，完全独立，自由重组;
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重组率可用来表示基因间的遗传图距(cM)，1cM相当于1%的重组率。
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QTL定位：对QTL的定位必须使用遗传标记，人们通过寻找遗传标记和感兴趣的数量 性状之间的联系，将一个或多个QTL定位到连锁群的相应位置，并估计其 遗传效应。
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辅助基因组组装
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比较基因组学研究
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分子标记辅助育种 (MAS)
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2. 构建遗传图方法
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这里作图群体，没怎看懂，以后补充
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分子标记：是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段。
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3. 高通量分析内容与结果
3.1. 高密度遗传图谱信息分析内容
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