动物线粒体基因组注释软件MITOS2安装与使用

MITOS2可用于注释后生动物以及真菌等线粒体基因组注释，主要注释线粒体18个核心基因（atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2 cox3 dpo lagli msh1 mttb nad1 nad2 nad3 nad4 nad4l nad5 nad6）

GitLab下载网站 MITOS GutLib，可用于linux系统上进行分析，
MITOS在线分析网站MITOS在线分析工具，可以将多个个体的线粒体基因组序列合并一起成fasta文件提交

以下讲述linux安装使用

安装

pip3 install mitos  -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/

下载参考基因数据库Reference data，小编这里下载refseq63m.tar.bz2

使用

runmitos.py -i sequence.fa  -c 2 -r refseq63m --refdir /path/refdata -o output

参数可以参考在线网站上的参数：

-c参数是选用物种类别，2表示脊椎动物，4表示霉菌，5表示无脊椎动物
-r参考序列库，自己下载的库名称
--refdir参考库所在路径