iTOL（Interactive Tree Of Life）是一款在线进化树美化软件，功能强大，可以展示各种数据。
网址：https://itol.embl.de/

上传树文件

文本格式复制粘贴或者直接上传文件（newick 格式进化树）

基本设置

control 面板可以调整树的形状（圈图、辐射图或者常见的normal 格式）、字体大小及颜色、是否显示bootstrap 值等信息。

添加注释

如果想在图中添加更多的信息，就需要自己准备好配置文件，将每个dataset 配置信息单独写到文本文件中，注意指定分隔符，准备好文件后，将文件拖拽到进化树美化页面。然后微调这些dataset，得到最终美化的进化树图片。

label 颜色调整

**示例**
# 指定dataset类型
TREE_COLORS
# 指定文件分隔符
SEPARATOR TAB
# 指定数据，第一列为label， # 第二列写为"label"
# 第三列为颜色
# 第四列为字体
# 第五列为字体大小
DATA
sind|SIN_1004729    label   #6633ff bold    1.5
sind|SIN_1014454    label   #6633ff bold    1.5
sind|SIN_1005002    label   #6633ff bold    1.5
sind|SIN_1005003    label   #6633ff bold    1.5
sind|SIN_1005004    label   #6633ff bold    1.5
gmax|KRH46136   label   #DA70D6 bold    1.5
gmax|KRG98807   label   #DA70D6 bold    1.5
atha|AT1G62190.1    label   #dc143C bold    1.5
atha|AT2G22890.1    label   #dc143c bold    1.5
atha|AT4G27030.1    label   #dc143c bold    1.5

背景颜色调整

**示例**
TREE_COLORS
SEPARATOR TAB
# 指定数据
# 第一列为 label
# 第二列写为"range",第三列为颜色
DATA
sind|SIN_1004729    range   #6633ff 
sind|SIN_1014454    range   #6633ff 
sind|SIN_1005002    range   #6633ff 
sind|SIN_1005003    range   #6633ff 
sind|SIN_1005004    range   #6633ff 
gmax|KRH46136   range   #7CFC00 
gmax|KRG98807   range   #7CFC00 
atha|AT1G62190.1    range   #dc143C 
atha|AT2G22890.1    range   #dc143c 
atha|AT4G27030.1    range   #dc143c 

显示symbol，dataset 类型为Binary

iTOL 中图形编号
![](https://img.haomeiwen.com/i27313279/cfbd7bd0e30f8033.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
**示例**
DATASET_BINARY
SEPARATOR TAB
DATASET_LABEL   label1
FIELD_SHAPES    2   4   5   1
FIELD_LABELS    f1  f2  f3  f4
FIELD_COLORS    #ff0000 #00ff00 #ffff00 #0000ff

DATA
sind|SIN_1004729    1   -1  1   1
sind|SIN_1014454    -1  1   -1  1
sind|SIN_1005002    0   1   0   1
sind|SIN_1005003    1   0   1   0
sind|SIN_1005004    1   -1  0   -1
gmax|KRH46136   1   -1  0   -1
gmax|KRG98807   1   -1  0   -1
atha|AT1G62190.1    1   -1  0   -1
atha|AT2G22890.1    1   -1  0   -1
atha|AT4G27030.1    1   -1  0   -1

barchart 条形图

**示例**
##指定dataset类型
DATASET_SIMPLEBAR
SEPARATOR TAB
##指定dataset名称
DATASET_LABEL   barchat2
COLOR   #FF8C00

##第一列为label,第二列为做条形图的数值
DATA
sind|SIN_1004729    10
sind|SIN_1014454    5
sind|SIN_1005002    2
sind|SIN_1005003    4
sind|SIN_1005004    7
gmax|KRH46136   6
gmax|KRG98807   3
atha|AT1G62190.1    7
atha|AT2G22890.1    1
atha|AT4G27030.1    9

饼图

**示例**
DATASET_PIECHART
SEPARATOR TAB
DATASET_LABEL   piechat
FIELD_COLORS    #00BFFF #FFD700
FIELD_LABELS    p1  p2
#ID,position,radius,value1,value2,value3...
#position defines the position of the pie chart on the tree:
#  -1 = external pie chart
#  a number between 0 and 1 = internal pie chart positioned at the specified value along the node branch (for example, position 0 is exactly at the start of node branch, position 0.5 is in the middle, and position 1 is at the end)
# 第1列为label
# 第2列指定位置 -1表示画在树的外部
# 第3列为饼图半径
# 第4、5列为饼图的作图数据

DATA
sind|SIN_1004729    -1  10  10  5
sind|SIN_1014454    -1  10  5   4
sind|SIN_1005002    -1  10  2   3
sind|SIN_1005003    -1  10  4   3
sind|SIN_1005004    -1  10  7   4
gmax|KRH46136   -1  10  6   3
gmax|KRG98807   -1  10  3   2
atha|AT1G62190.1    -1  10  7   3
atha|AT2G22890.1    -1  10  1   4
atha|AT4G27030.1    -1  10  9   6

最终结果