基于docker安装使用RGAugury鉴定抗性基因

第一步：安装

docker image pull yaanlpc/rgaugury:2.2

第二步：挂载目录并使用测试数据

docker run -it  --mount=type=bind,source=/40t_1/caix/software/database/pfam,target=/opt/pfam  --mount=type=bind,source=/40t_1/caix/software/database/interproscan-5.60-92.0,target=/opt/interproscan   --mount=type=bind,source=/40t_2/dockers/DataRGAugury,target=/root/input   yaanlpc/rgaugury:2.2 /bin/bash

注意：需要提前下载好interproscan和pfam数据库。需要预测抗性基因的蛋白文件存放到个人目录/40t_2/dockers/DataRGAugury，输出结果也在此目录。