生物数据库(一)

2020-05-14  本文已影响0人  Peng_001

现存数据库有超过2000种

分为三类:核酸数据库、蛋白质数据库、专用数据库

Pubmed 数据库

索引方法


pubmed 数据库索引内容如上图所示。
因此可以根据特定的索引找到相关内容。


使用精确搜索功能



Pubmed 也不是万能的。


genebank

查看原核生物的基因序列

locus 相当于身份证号
accession 相当于学号(不同数据库不一样)


翻译产物信息


同一条基因,还可能有其他潜在翻译产物


碱基信息


通过FASTA获取核酸信息

还可以获得图形化信息


查看真核细胞基因序列

跟gene 信息查询到的内容相似

并非所有数据库的信息都能确保准确


还有两个新的条目


gene 序列信息

mRNA 存在两种:线粒体与真核

线粒体多了一个翻译为信号肽的mRNA(表示转录为线粒体RNA,最后也会被切除)


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