JBrowse会显示红色Error框处理
前言:先宣传一波我们自己开发的数据库,欢迎大家多提意见,多引用。
自从我们第一个版本发布之后(Jin et al, 2013 Bioinformatics),就获得了大量的访问。为创造性地开发一套更为科学系统、精准实用的百科全书式长链非编码RNA数据库,我们自NCBI公共数据库搜集整理的80种重要植物的13834个转录组测序数据,在全面整合其他现有资源的基础上,鉴定了1246372个植物长链非编码RNA(含31028个烟草长链非编码RNA),开发了植物长链非编码RNA数据库PLncDB(http://plncdb.tobaccodb.org/)(Jin et al, 2020, NAR)。
目前,数据库可实现植物长链非编码RNA基因组位置、序列、结构、表达、表观遗传、调控网络等信息的全方位查询与可视化展示。同时,5个搜索引擎及JBrowse、eFP Browser、EPexplorer等分析工具,为数据库提供了强大的数据分析能力。作为一站式数据库,PLncDB将为植物与烟草长链非编码RNA研究提供更为精准、全面的大数据分析平台支撑。
最近因为在搬迁数据库的服务器,所以有用户反应了一些bug,具体表现在,某些annotation的track处显示红色的error。
debug之后发现,当某些注释文件在当前染色体上面没有注释的话,会显示红色error。所以,最后解决方法是当发生这种情况的时候,不抛出error的注释信息。
可以通过更改jbrowse根目录index.html,注释掉window.onerror函数来隐藏错误信息。
//window.onerror=function(msg){
// if( document.body )
// document.body.setAttribute("JSError",msg);
//}
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