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Paper_3: 正常输卵管上皮细胞的单细胞测序揭示了浆液性卵巢

2020-02-19  本文已影响0人  TOP生物信息

Highlights

  1. 利用输卵管上皮细胞(FTE)的亚型定义了浆液性卵巢癌(SOC)的分子分型
  2. FTE细胞在单细胞水平上的整体描述鉴定了6种分子亚型的细胞类群
  3. 在1700个高级浆液性卵巢癌(HGSOC)的肿瘤bulk样本中鉴定到了大量非遗传异质性的存在
  4. 一种间叶细胞含量高的HGSOC亚型和较差的预后显著相关

Summary

不同细胞状态之间的分化促进了肿瘤细胞的逆境生存,同时也加快了非遗传异质性(NGH)的形成。非遗传异质性表征了肿瘤适应力,但是其定量描述常常受到遗传异质性的干扰。基于我们的研究,我们得到了这样的结论:利用正常输卵管上皮细胞(FTE, SOC的起源细胞)的分子特征,可以精确地测量浆液性卵巢癌(SOC)中的NGH。我们一共研究了大约6000个输卵管上皮细胞,大多数来自于非卵巢癌患者,从中鉴定了6种FTE细胞亚型。我们用这些细胞亚型的特征去拆解SOC bulk表达数据,发现了大量的肿瘤内NGH。对1700个病人进行了基于NGH的分层,结果显示与预后存在强烈的相关性。我们的发现为SOC的精准预后和治疗分层奠定了基础。


这篇文章认真读过,思路很新,从NGH入手,对正常上皮细胞做分群,再来做deconvolution与预后联系。

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