基因组辅助育种Animal Genetics

虾基因组选择研究进展

2021-10-29  本文已影响0人  Hello育种
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讲座来自:栾生 研究员(中国水产学研究院黄海水产研究所)

1 背景介绍

人缺乏食物,可以来自水产解决,更高的饲料转换率。


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研究虾品种介绍:


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我国虾的养殖:


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其工作的对象:


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选择模式:以家系为单位,以荧光染料进行标记:

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但是家系选择受限:


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核心场和生产场的环境差异:G X E

系谱有错误:

虾目前使用目前使用:


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已经报告研究:


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应使用H矩阵,但是还是存在的问题:


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SSGBLUP算法:


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ss贝叶斯法(ssBR):


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2 试验结果

2.1 增加亲本的测序个体,后裔测定法验证:


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2.2 抗病性状研究结果:
WSSV病毒


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2.3 芯片(液相,55k)


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3 展望

3.1 机器学习来拿到表型,借鉴植物的表型收集计算。
表型(100个以上)推断基因型;
MegaLMM算法处理多表型数据:


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3.2 新的挑战
准确性:
G的求逆,
水稻中的基因组,转录组,代谢组的整合预测。

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4 结语

可持续发展


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