开学第二周第一天正月十六-circos基因组作图

年就算是过完了。今天开始要出东西了！fight！

#Circos-3#有手就行！TBtools教你打造炫酷circos图_哔哩哔哩_bilibili

这个系列的相似文字版是这个。零基础小白手把手绘制Circos图（物种间共线性、去除碎片、基因密度）全过程 (qq.com)

iMeta | 华南农大陈程杰/夏瑞等发布TBtools构造Circos图的简单方法 (qq.com)

 其实有TBtools画circos不难，如果想挑战一下那你就自己去官网琢磨吧。Course // CIRCOS Circular Genome Data Visualization。是用perl编译的。perl处理文字很强。作为全是字母的基因组数据应该是要掌握一些perl的

取自https://www.bilibili.com/video/BV1pK411P7Dy/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=deb077a77adc99b39c5bbfd6c519f2a2

教程：(3条消息) Circos入门教程_华大基因学院的博客-CSDN博客_circos数据准备

R语言绘制circos 用到的R包：RCircos

今天啥也没做完 over

问了老师，问她用啥画圈图，她说用jcvi。这玩意conda就能安。还是创个环境会比较方便。

如何安装JCVI | 徐洲更的第二大脑 (xuzhougeng.top)

物种内共线性分析——JCVI安装以及数据下载（一） | 生信技术 (lxz9.com) 。

需要last库，这个conda也能安装。

做了一个贼基础的图。低情商：很丑的图