Linkedomics数据库使用介绍
2022-03-03 本文已影响0人
期待未来
Linkedomics
Linkedomics属性(Attribute)是指待探索的基因、microRNA等;待查数据集(Search Dataset)指待筛选数据集的属性,包括RNA-seq、甲基化、突变和miRNA等;靶数据集(Target Dataset)指作为参照或总体的数据集;肿瘤队列(Cancer cohort)指研究的肿瘤类型。
以基因在数据库中的表达为例:
- Step 1 - 登陆账号(需要edu邮箱)
- Step 2 - 选择数据集:如肾上腺皮质腺癌 Adrenocortical carcinoma (ACC)
- Step 3 - 选择数据类型-HiSeq RNA(高通量RNA-seq)
- Step 4 - 可选项,数据要求,如肿瘤的分期分级
- Step 5 - 选择想要研究的基因
- Step 6 - 选择统计学方法,然后点击“submit query”如pearson correlationl test
- Step 7 - 生成后不是自动选择呈现的数据,要自动点击圆点后页面下方才会有结果显示。