相关性
2019-08-04 本文已影响3人
YX_Andrew
在 统计学中, 以查尔斯·斯皮尔曼命名的斯皮尔曼等级相关系数，即spearman相关系数。经常用希腊字母ρ表示。 它是衡量两个变量的依赖性的 非参数 指标。 它利用单调方程评价两个统计变量的相关性。 如果数据中没有重复值， 并且当两个变量完全单调相关时，斯皮尔曼相关系数则为+1或−1。
Mantel test 分析两个距离矩阵之间的相关性
做微生物菌落少不了分析环境因子（pH，有机碳，总氮，盐度等）与菌落的相关性，此时便需要做CCA和Mantel test 分析。有时CCA分析结果可能难以比较，这时候做一下Mantel test 进行分析可以直观的根据所求 r值和显著性水平P值来对环境因子和微生物菌落分布相关性有个大致了解。
【1】 Hollister EB, Engledow AS, Hammett AJ, Provin TL, Wilkinson HH, Gentry TJ. Shifts in microbial community structure along an ecological gradient of hypersaline soils and sediments. The ISME journal 2010;4:829-38.
【2】Yang J, Ma La, Jiang H, Wu G, Dong H. Salinity shapesmicrobial diversity and community structure in surface sediments of theQinghai-Tibetan Lakes. Scientific Reports 2016;6.
