NG | 孟德尔随机分析菌群&代谢物因果关系
文章
标题：Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabolites and the gut microbiome
中文：孟德尔随机化分析支持了血液代谢物和肠道菌群的因果关系
期刊：Nature Genetics
时间：2022.1.3
单位：BGI深圳
摘要
肠道微生物群与各种生理状态有关，但关于因果关系的争议仍未解决�。在此，我们对3432名具有全基因组、全宏基因组、人体计量学和血液代谢特征数据的中国个体进行了双向孟德尔随机化分析。我们确定了肠道微生物群和血液代谢物之间的58种因果关系，并复制了其中的43种。粪便Oscillibacter和Alistipes相对丰度的增加与甘油三酯浓度的降低有因果关系。相反，血液代谢物如谷氨酸似乎降低了粪便草酸杆菌，变形菌门的成员受到代谢物如5-甲基四氢叶酸、丙氨酸、谷氨酸和硒的影响。来自日本生物库的两样本孟德尔随机化方法部分证实了甘油三酯和尿酸的结果，也为已发表的癌症和心血管疾病的粪便细菌标记物提供了因果支持。这项研究说明了人类遗传信息的价值，以帮助优先考虑肠道微生物特征的机制和临床研究。
研究设计
结果
1 粪便微生物与宿主遗传变异相关
独立遗传变异对细菌特征变化的解释度
2 血液中的代谢物与宿主遗传变异有关
独立遗传变异对血液代谢物变化的解释度
3 从观察的相关到孟德尔随机
肠道微生物和血液代谢物58对存在因果联系
4 肠道微生物对血液中代谢物的影响
Oscillibacter和Alistipes菌属与血液甘油三脂的因果关系
5 血液中代谢物对肠道微生物的影响
6 肠道微生物和疾病的因果关系
使用六种不同的two-sample MR方法
Proteobacteria和疾病
Escherichia coli和疾病
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Nat Genet | 孟德尔随机方法助力肠道菌群与血液指标的因果关系发掘
Nature子刊：血液代谢物与肠菌的因果关系
