调用代码时，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用?read.table这个命令查看帮助：，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。

数据类型

• 向量（vector）
• 矩阵（Matrix）
• 数组（Array）
• 数据框（Data frame）
• List

一、向量

1、标量与向量的区分

标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
注：元素指的是数字或者字符串（用chr表示）

使用时，一般都会直接给变量定义，也就是“赋值”，字面意思是赋予这个变量一个数值（其实也不一定是数值，还可以是字符串/数据框等等）。

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

2.从向量中提取元素

（1）根据元素位置

#这里的x是刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

（2）根据值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

二、数据框

长的和表格挺像的

变量

1.读取本地数据

read.table(file="doudou.txt",sep="\t",header = T)
a <- read.table(file="doudou.txt",sep="\t",header = T)

2.设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "doudou.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

咋出来这个结果的？

3.数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） 

4.变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

5.提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

6.直接数据框中的变量

心情一般，不想再学了今天