R语言生信分析——表达矩阵数值问题
2018-12-01 本文已影响0人
JohnSongJi
矩阵数据,包括基因,样本,和表达数据,这些表达数据一般是取过log2的,也有特殊情况。正常情况,数值比较小的话,一般10以下,是取过log2的;如果数值很大就是没有取过log2的。
比如GPL570的矩阵就是没有取过log2的。
将原始表达矩阵eset (共24列)进行简单转换:
eset[,1:24]<-log2(eset[,1:24])
矩阵数据,包括基因,样本,和表达数据,这些表达数据一般是取过log2的,也有特殊情况。正常情况,数值比较小的话,一般10以下,是取过log2的;如果数值很大就是没有取过log2的。
比如GPL570的矩阵就是没有取过log2的。
将原始表达矩阵eset (共24列)进行简单转换:
eset[,1:24]<-log2(eset[,1:24])