R语言的参考网站

RStudio Cheat Sheets （https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/）

安装R包 (tidyr)

1. 设置国内镜像
   tools-global tools-packages-CRNA mirror-China (beijing)[https] - TUNA Team, Tsinghua University
2. 安装包
   install.packages('安装包的名字')
3. 运行包
   library(tidyr)

数据框的构建与整理（推荐文件格式为csv）

a <- data.frame(GeneID=rep("gene3",times=3),
                samplename=paste("sample",1:3,sep = ""),
                expression=c(14,19,18)
                )
#paste,连接2个字符串，括号要填2个连接字符并指定分隔符（sep），没有分隔符就填sep = ""
View(a)

使用tidyr包将数据处理成Tidy data（标准而统一的数据框）

1. 数据框的构建

2. 数据框列名的合并

#方法1
gather(数据框名,key="合并后的key列名",value="合并后的value列名",需要合并的列名1,需要合并的列名2)
#方法2
gather(数据框名,key="合并后的key列名",value="合并后的value列名",-列名1)
#-列名1的意思就是合并除列名1外剩下的列

3. 数据框的读取及导出

#导入
s<-read.csv("文件名.csv")
#导出
write.csv(变量名，"文件名.csv")

4. 处理数据框中缺失的数据

• 整行删掉
  drop_na(数据框名，打算删除的行名)
• 根据上一行的数值填充
  fill(数据框名，打算填充的行名)
• 在缺失处填入特定的数值
  replace_na(数据框名，list(打算填充的行名=要填的数值))