Linux下的软件安装

miniconda

专门做生信的软件管理器

安装步骤

1、输入bzip2
2、cd biosoft进入wgt下载地址 一路yes,一路enter
3、source ~/.bashrc来激活conda

装国内镜像

conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes

使用软件

• 查看当前所有软件列表 conda list
• 搜索软件 conda search 8888
• 安装软件 conda install fastqc -y
• 卸载软件 conda remove fastqc -y

心得

今天装的很不顺利，那个删除miniconda 一直出错。结果让我体会到rm -rf的命令。
小白摸索ing

by黄小喵