trf预测异常

官网：https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF

异常：trf卡着没有结果，版本v4.0.9，2020年发布，查看发现存在一条100多Mb的contig，所以卡着一直没有输出

 /share/nas2/genome/biosoft/trf/409/trf  final.BV890.asm.bp.p_ctg.fa.029   2 7 7 80 10 50 500 -l 10 -d -h

解决方法：按照以往的解决异常的思路，尝试更新到最新版v4.10.0. github 释放的还没到4.10.0，但是这样下载时最新版，有点奇怪。

wget https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF/archive/master.zip

wget wget https://hub.yzuu.cf/Benson-Genomics-Lab/TRF/archive/master.zip #如果失败尝试这个

unzip master.zip  && mv TRF-master trf-4.10  && cd TRF-master

./configure --prefix=/share/nas1/pengzw/software/trf-4.10

make;make install

/share/nas1/pengzw/software/trf-4.10/bin/trf -v

Tandem Repeats Finder, Version 4.10.0
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结果：更新软件版本后，顺利出结果，应该是软件的bug导致，建议分析时尽可能更新到较为新的版本。