R语言基础

认识R和Rstidio

R是一种免费开源的编程语言，对于生信分析十分友好，因为它汇集了很多函数，很多包，能够大部分的下游分析，统计计算，绘图。
Rstudio 是一款R语言的IDE,因为本身R自带的环境对于操作者来说不太友好，Rstudio提供了很多调试，可视化的功能与环境，使R的使用更为方便。

基础设置

打开Rstutio后，点击Tools--global options，在general中可以设置默认的R版本，appearance里可以设置字体大小，主题等，有兴趣的可以每个选项都尝试一下。

R语言基本操作

1.设置工作目录

设置好工作目录，可以将脚本、文件、图片等都保存到该目录中，防止找不到。

getwd()  #查看当前工作目录
setwd(新地址) #设置新的工作目录

或者每次新建project时，设置好名称和位置，以后每次打开都直接打开这个project即可。

2.显示文件列表

dir() #查看当前工作目录里的文件，类似于linux中的ls

3.赋值

<-是赋值，例如

x<-3 #将3赋值给x

4.删除变量

rm(变量名)
rm（list=ls()）#删除所有变量