从R中安装phylotaR包经验
2021-02-25 本文已影响0人
雨林课堂
1. 在RStudio中设置镜像为国内清华大学镜像；
2. 安装Rtools工具至PATH
从R 4.0.0（2020年4月发布）开始，R for Windows使用了一个全新的工具链捆绑包rtools40。
3. 安装phylotaR包，参考链接如下
https://github.com/ropensci/phylotaR
From CRAN:
install.packages('phylotaR')
Or, download the development package from GitHub:
devtools::install_github(repo='ropensci/phylotaR',build_vignettes=TRUE)
Full functionality depends on a local copy of BLAST+ (>= 2.0.0). For details on downloading and compiling BLAST+ on your machine please visit the NCBI website.
