服务器上安装bioconductor时遇到的问题

2019-04-20  本文已影响0人  良田农庄

安装bioconductor这次遇到了很大的问题,一直提示若干其他的问题,
发现还是网速的和网络链接的问题导致的,时好时不好,
这里在在服务器中安装conda
conda下安装最新版本的R(非root伤不起)
结果一直出幺蛾子
首先是source不进去,这里就需要修改一下Rprofile的内容了,在R所在的安装路径中使用find指令检索一下该文件存在
find - name “Rprofile”
检索到全路径之后就vim加全路径,将清华的镜像添加进去
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
退出之后,source更新一下Rprofile就可以进入R里面使用Biocinstaller了

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