m6A三大机制思路2-目标基因上游甲基化机制
2020-12-15 本文已影响0人
纪伟讲测序
m6A是N6-腺苷酸甲基化，当RNA分子发生甲基化后，m6A甲基化识别酶可以与RNA分子结合，调控RNA的稳定或者降解。RNA分子表达量升高与降低改变正常蛋白的表达量，影响功能。那么m6A机制研究的思路是怎样的，如果不考虑lnc/circRNA等非编码分子怎么研究m6A的机制？
在上一期“m6A三大机制思路1 - 以甲基酶切入”， 我们找到了一些重要基因，向下游做机制，为了完善通路，我们也希望向上游找机制。目标基因为什么上下调，除了受到转录过程（比如转录因子）调控外，也可以考虑甲基化。毕竟该基因的mRNA自身甲基化状态改变，会影响mRNA的稳定性，这样也就解释了，目标基因为什么发生变化。
主要讨论内容：
（1）我们研究某个基因/分子的功能，如何找上游机制 ？
（2）向上游找m6A甲基化的思路是什么 ？
（3）向上游关联m6A需要怎样的条件 ？
以下是视频录屏链接，有需要的老师可以观看。
