微卫星不稳定性2021-02-01 本文已影响0人 小森的生统笔记 输入文件 第一列样品名称,第二列微卫星不稳定性打分 如果自己做下载Bam文件很大,可以用前人保留的文件 基因表达文件 脚本 读取表达文件和MSI文件,删除正常样品,两个文件取交集 相关性检验,对肿瘤类型进行循环,提取表达数据,MSI数据,转换为数值,进行spearman相关性检验,得到pvalue 把肿瘤名称与MSI相关系数和pvalue输出;pvalue可以带有显著性检验标星 雷达图