基因功能验证学习笔记（1）

如何确定一个基因的功能？

        基因的功能通常和表型联系在一起，因此，研究基因的功能通常有两个方向：经典的遗传学方法，开始研究突变表型以确定突变基因，这也就是所谓的正向遗传学；反向遗传学是相对于经典遗传学而言的。经典遗传学是从生物的形状、表型到遗传物质来研究生命的发生与发展规律。反向遗传学则是在获得生物体基因组全部序列的基础上,通过对靶基因进行必要的加工和修饰,如定点突变、基因插入\缺失、基因置换等,再按组成顺序构建含生物体必需元件的修饰基因组,让其装配出具有生命活性的个体,研究生物体基因组的结构与功能,以及这些修饰可能对生物体的表型、性状有何种影响等方面的内容。与之相关的研究技术称为反向遗传学。

          传统的利用正向遗传学方法的基因定位一般是通过构建遗传连锁图谱进行的，该过程步骤繁琐、耗时耗力，很多情形下定位精确度低、区间大。随着高通量测序技术的快速发展以及测序成本的不断降低，多种简单快捷的利用测序手段定位基因的方法被开发出来，包括对突变体基因组直接测序定位、突变体材料构建混池测序定位和遗传分离群体测序构建图谱定位等，还可以对转录组和部分基因组进行测序定位----《高通量测序技术结合正向遗传学手段在基因定位研究中的应用》。个人认为研究基因的功能，不妨将正向遗传法和反向遗传法相结合，一方面通过诱变获得表型，从而鉴定对应的突变基因；另一方面通过测序等方法获得表型相关差异基因，通过CRISPR-Cas9等技术进行突变验证。