【单细胞分析】如何分析展示单细胞聚类后数据？

简介

对于单细胞分析已经有了较常规的分析方法，对于10X数据完成建库处理后可以直接利用自带的cellranger 软件进行细胞定量，后边可以利用单细胞神包Seurat进行降维聚类，鉴定细胞类型。对于这些结果可以如何进行更好的展示呢，或者说单细胞文献常用的展示架构如何体现，本文就是结合已发表的一些文献，对当前常用的展示方式做简单综述。
对于F1的展示，通常为整体展示单细胞的图谱情况

画发育树辅助细胞类型注释

画发育树辅助细胞类型注释

群内不同层次细胞比例情况

群内不同层次细胞比例情况

不同层次差异基因表达展示

不同层次差异基因表达展示

参考材料：

1. DIO：10.1038/s41590-018-0276-y