R语言python处理数据与数据可视化遥感

如何做出相关系数矩阵可视化图

2016-12-11  本文已影响2422人  G小调的Qing歌

如何在R中优雅地绘制相关系数矩阵

install.packages("psych") 
install.packages(“corrplot”)#安装包,如果已安装,请略过 
library(psych) 
library(corrplot)#载入两个包 
data(iris)#机器学习常用神奇数据集——鸢尾花数据集 
head(iris)#查看下数据集前五行 
irisnew<-iris[,-5]#去除第五列种类变量 
cormat<-corr.test(irisnew)#相关系数分析及显著性检验
#最简单的相关系数矩阵可视化
corrplot(cormat$r)
这里写图片描述
corrplot(cormat$r,method="square")
这里写图片描述
corrplot(cormat$r,method = "number")
这里写图片描述
corrplot(cormat$r,method = "shade")
这里写图片描述
corrplot(cormat$r,method="ellipse")
这里写图片描述
corrplot(cormat$r,method = "pie")
这里写图片描述
corrplot(cormat$r,method="square",type="lower",title = "Correlation of iris")
这里写图片描述
#含显著性检验的相关系数矩阵可视化
cormatp<-cormat$p#单独取出p值矩阵
cormatp[upper.tri(cormatp)]=0#设置p值矩阵上三角等于0
corrplot(cormat$r,method="square",type="lower",title = "Correlation of iris",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))
这里写图片描述
corrplot(cormat$r,method="square",type="full",title = "Correlation of iris",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))
这里写图片描述
corrplot.mixed(cormat$r,upper = "square",lower = "number",diag = "u",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))
这里写图片描述
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