导--五种蝙蝠的转录组重组与功能注释

摘要

高通量RNA测序是一个强大的工具，使我们能够进行基因预测和分析组织特异性基因的过度表达，但也可以进行物种水平的比较，尽管是以更有限的方式。在本研究中，五个热带蝙蝠物种的完整肝脏转录组被重新组装和注释。这五个物种的高表达基因涉及糖酵解和脂质代谢途径。使用五个物种之间共享的单拷贝正交物进行了跨物种差异表达分析。每个物种都有22到29个直系亲属被上调。我们检测到Artibeus jamaicensis与果糖代谢途径相关的基因表达上调。这样的发现可以与A. jamaicensis的饮食习惯相关，因为它是其中唯一的节俭型物种。这是第一个通过RNA-seq对这些物种进行转录组组装的报告，除了A. jamaicensis，据我们所知，这是第一个对热带蝙蝠的转录组和基因表达进行的跨物种比较。

翼手目是哺乳动物的第二大目，分为两个亚目: 银翼目和翼手目。它的多样性包括和估计约1331种分布在世界各地，除了极地地区和孤立岛屿。蝙蝠的食性表现出广泛的多样性，可能是肉食性、果食性、血食性、食虫性或蜜腺性;因此，通过提供重要的生态服务，直升机在维持生态系统平衡方面发挥着至关重要的作用;三分之二的蝙蝠是食虫动物，因此被认为是具有农业重要性的生物害虫防治手段。与鸟类和昆虫相似，食蜜动物也扮演着传粉者的角色，通过传粉促进开花植物之间的基因交换。果食性物种在受干扰的景观修复和由于种子传播而维持生态系统内的植被方面起着至关重要的作用。蝙蝠能在多种多样的生态环境中生存是进化过程的结果，进化过程导致了各种适应性的出现，如回声定位和飞行能力，这些都是蝙蝠的显著特征。