配置anaconda
Anaconda 是一个包含数据科学常用包的 Python 发行版本。它基于 conda ——一个包和环境管理器——衍生而来。你将使用 conda 创建环境,以便分隔使用不同 Python 版本和不同程序包的项目。你还将使用它在环境中安装、卸载和更新包。通过使用 Anaconda,处理数据的过程将更加愉快。
安装 Anaconda
Anaconda 可用于 Windows、Mac OS X 和 Linux。可以在 https://www.continuum.io/downloads 上找到安装程序和安装说明。
如果计算机上已经安装了 Python,这不会有任何影响。实际上,脚本和程序使用的默认 Python 是 Anaconda 附带的 Python。
选择 Python 3.6 版本(你也可以根据具体的需要选择 Python 2 的版本)。此外,如果是 64 位操作系统,则选择 64 位安装程序,否则选择 32 位安装程序。继续并选择合适的版本,然后安装它。之后,继续进行!
完成安装后,会自动进入默认的 conda 环境,而且所有包均已安装完毕,如下面所示。可以在终端或命令提示符中键入 conda list
,以查看你安装的内容。
在 Windows 上,会随 Anaconda 一起安装一批应用程序:
Anaconda Navigator,它是用于管理环境和包的 GUI
Anaconda Prompt 终端,它可让你使用命令行界面来管理环境和包
Spyder,它是面向科学开发的 IDE
为了避免报错,我推荐在默认环境下更新所有的包。打开 Anaconda Prompt (或者 Mac 下的终端),键入:
conda upgrade --all
并在提示是否更新的时候输入 y(Yes)以便让更新继续。初次安装下的软件包版本一般都比较老旧,因此提前更新可以避免未来不必要的问题。
管理包
安装了 Anaconda 之后,管理包是相当简单的。要安装包,请在终端中键入 conda install package_name。例如,要安装 numpy,请键入
conda install numpy
你还可以同时安装多个包。类似
conda install numpy scipy pandas
的命令会同时安装所有这些包。还可以通过添加版本号(例如
conda install numpy=1.10
来指定所需的包版本。
Conda 还会自动为你安装依赖项。例如,scipy 依赖于 numpy,因为它使用并需要 numpy。如果你只安装 scipy (conda install scipy),则 conda 还会安装 numpy(如果尚未安装的话)。
大多数命令都是很直观的。要卸载包,请使用 conda remove package_name。要更新包,请使用 conda update package_name。如果想更新环境中的所有包(这样做常常很有用),请使用 conda update --all。最后,要列出已安装的包,请使用前面提过的 conda list。
如果不知道要找的包的确切名称,可以尝试使用 conda search search_term
进行搜索。例如,我知道我想安装 Beautiful Soup,但我不清楚确切的包名称。因此,我尝试执行
conda search beautifulsoup
它返回可用的 Beautiful Soup 包的列表,并列出了相应的包名称 beautifulsoup4。
管理环境
如前所述,你可以使用 conda 创建环境以隔离项目。要创建环境,请在终端中使用 conda create -n env_name list of packages。在这里,-n env_name 设置环境的名称(-n 是指名称),而 list of packages 是要安装在环境中的包的列表。例如,要创建名为 my_env 的环境并在其中安装 numpy,请键入 conda create -n my_env numpy。
创建环境时,可以指定要安装在环境中的 Python 版本。这在你同时使用 Python 2.x 和 Python 3.x 中的代码时很有用。要创建具有特定 Python 版本的环境,请键入类似于 conda create -n py3 python=3 或 conda create -n py2 python=2 的命令。实际上,我在我的个人计算机上创建了这两个环境。我将它们用作与任何特定项目均无关的通用环境,以处理普通的工作(可轻松使用每个 Python 版本)。这些命令将分别安装 Python 3 和 Python 2 的最新版本。要安装特定版本(例如 Python 3.3),请使用 conda create -n py python=3.3。
进入环境
创建了环境后,在 OSX/Linux 上使用 source activate my_env 进入环境。在 Windows 上,请使用 activate my_env。
进入环境后,你会在终端提示符中看到环境名称,它类似于 (my_env) ~ $。环境中只安装了几个默认的包,以及你在创建它时安装的包。你可以使用 conda list 检查这一点。在环境中安装包的命令与前面一样:conda install package_name。不过,这次你安装的特定包仅在你进入环境后才可用。要离开环境,请键入 source deactivate(在 OSX/Linux 上)。在 Windows 上,请使用 deactivate。
保存和加载环境
共享环境这项功能确实很有用,它能让其他人安装你的代码中使用的所有包,并确保这些包的版本正确。你可以使用 conda env export > environment.yaml
将包保存为 YAML。命令的第一部分 conda env export
用于输出环境中的所有包的名称(包括 Python 版本)。导出命令的第二部分 > environment.yaml
将导出的文本写入到 YAML 文件 environment.yaml 中。现在可以共享此文件,而且其他人能够用于创建和你项目相同的环境。
要通过环境文件创建环境,请使用 conda env create -f environment.yaml。这会创建一个新环境,而且它具有同样的在 environment.yaml 中列出的库。
列出环境
如果忘记了环境的名称(我有时会这样),可以使用 conda env list 列出你创建的所有环境。你会看到环境的列表,而且你当前所在环境的旁边会有一个星号。默认的环境(即当你不在选定环境中时使用的环境)名为 root。
使用环境
对我帮助很大的一点是,我的 Python 2 和 Python 3 具有独立的环境。我使用了 conda create -n py2 python=2
和 conda create -n py3 python=3
创建两个独立的环境,即 py2
和 py3
。现在,我的每个 Python 版本都有一个通用环境。在所有这些环境中,我都安装了大多数标准的数据科学包(numpy、scipy、pandas 等)。
我还发现,为我从事的每个项目创建环境很有用。这对于与数据不相关的项目(例如使用 Flask 开发的 Web 应用)也很有用。例如,我为我的个人博客(使用 Pelican)创建了一个环境。
共享环境
在 GitHub 上共享代码时,最好同样创建环境文件并将其包括在代码库中。这能让其他人更轻松地安装你的代码的所有依赖项。对于不使用 conda 的用户,我通常还会使用 pip freeze
(在此处了解详情)将一个 pip requirements.txt
文件导出并包括在其中。
了解更多信息
要详细了解 conda 以及它如何融入到 Python 生态系统中,请查看这篇由 Jake Vanderplas 撰写的文章:Conda myths and misconceptions(有关 conda 的迷思和误解)。此外,如果你有空闲精力,也可以参考这篇 conda 文档。