kobas 3.0 做基因功能富集
2020-03-15 本文已影响0人
生信编程日常
http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3
KOBAS是一种广泛使用的基因富集(GSE)分析工具。它的版本1.0和2.0分别于2005年和2011年发。当前版本是KOBAS 3.0,该版本于2019年底发布,涵盖了5945种具有已知知识的物种。
KOBAS做基因富集,它可以接受基因列表或基因表达数据作为输入,结果生成富集的gene sets。之前的版本不支持gene symbol的输入,最新的3.0是支持的。更多的功能及方法:http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/help/
如果需要基因id转化,可以用这个网站:https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php
![](https://img.haomeiwen.com/i20297934/46279bda37bf3ac2.png)
可以按照需要做以下的分析:
![](https://img.haomeiwen.com/i20297934/56683d58991f63da.png)
提交就可以了。
同时,KOBAS还提供了注释功能,可以查询一个基因的不同名称
![](https://img.haomeiwen.com/i20297934/af0ce73d98ea3f38.png)
欢迎关注~
![](https://img.haomeiwen.com/i20297934/b3751a8bea411118.jpg)